Był żołnierzem AK, powstańcem warszawskim, wybitnym historykiem, od ponad 60 lat związanym z Lublinem. Wykładał na KUL i założył Instytut Europy Środkowo - Wschodniej.
W młodości Jerzy Kłoczowski walczył w AK. W czasie powstania warszawskiego służył w pułku "Baszta" i odniósł ciężkie rany w ataku na Królikarnię. Po wojnie studiował historię w Poznaniu i w Toruniu.
Od 1950 roku pracował na Katolickim Uniwersytecie Lubelskim. Zajmował się historią średniowiecznej Europy ze szczególnym uwzględnieniem Europy środkowo - wschodniej, oraz dziejami chrześcijaństwa w tym regionie. Był dziekanem Wydziału Nauk Humanistycznych KUL.
Współpracował z NSZZ Solidarność, a po wprowadzeniu stanu wojennego z jej podziemnymi strukturami. W 1989 r. został członkiem Komitetu Obywatelskiego przy Lechu Wałęsie. W latach 1990 - 1991 był senatorem.
Był inicjatorem powstania Instytutu Europy Środkowo - Wschodniej w Lublinie. Był również zaangażowany w ideę powstania Uniwersytetu Polsko - Ukraińskiego w Lublinie.
Był odznaczony Orderem Orła Białego.